Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms