Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MPP1Q00013 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms