Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms