Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRX1P78414 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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