Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SUMO1P63165 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms