Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms