Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CLDN2P57739 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CLDN2P57739 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CLDN2P57739 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CLDN2P57739 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CLDN2P57739 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CLDN2P57739 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CLDN2P57739 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CLDN2P57739 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN2P57739 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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