Protein–RNA interactions for Protein: P57071

PRDM15, PR domain zinc finger protein 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15P57071 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM15P57071 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms