Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms