Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC1P48995 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC1P48995 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC1P48995 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC1P48995 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC1P48995 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC1P48995 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC1P48995 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC1P48995 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC1P48995 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC1P48995 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC1P48995 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC1P48995 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPC1P48995 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC1P48995 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC1P48995 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC1P48995 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPC1P48995 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms