Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIP4K2AP48426 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms