Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AFMP43652 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AFMP43652 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AFMP43652 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AFMP43652 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AFMP43652 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AFMP43652 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AFMP43652 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AFMP43652 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms