Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms