Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC1P35052 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC1P35052 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPC1P35052 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPC1P35052 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPC1P35052 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPC1P35052 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPC1P35052 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms