Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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