Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms