Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms