Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms