Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms