Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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