Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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