Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERPIND1P05546 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms