Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POP4O95707 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POP4O95707 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms