Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms