Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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CCNDBP1O95273 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CCNDBP1O95273 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CCNDBP1O95273 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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