Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F6O75461 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F6O75461 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms