Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CYTIPO60759 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CYTIPO60759 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CYTIPO60759 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CYTIPO60759 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CYTIPO60759 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CYTIPO60759 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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