Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDB2O43679 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDB2O43679 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDB2O43679 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDB2O43679 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDB2O43679 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDB2O43679 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDB2O43679 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDB2O43679 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LDB2O43679 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDB2O43679 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDB2O43679 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDB2O43679 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDB2O43679 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDB2O43679 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDB2O43679 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDB2O43679 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDB2O43679 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms