Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRTO14522 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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