Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms