Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms