Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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