Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms