Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM149AA5PLN7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms