Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H5

SNCAIP, Synphilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAIPQ9Y6H5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNCAIPQ9Y6H5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNCAIPQ9Y6H5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNCAIPQ9Y6H5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms