Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIC4Q9Y696 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms