Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC6Q9Y625 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms