Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E1

PCDHB9, Protocadherin beta-9, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB9Q9Y5E1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDHB9Q9Y5E1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHB9Q9Y5E1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB9Q9Y5E1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB9Q9Y5E1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB9Q9Y5E1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB9Q9Y5E1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB9Q9Y5E1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB9Q9Y5E1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB9Q9Y5E1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB9Q9Y5E1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms