Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3V2

RWDD3, RWD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD3Q9Y3V2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RWDD3Q9Y3V2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD3Q9Y3V2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD3Q9Y3V2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD3Q9Y3V2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD3Q9Y3V2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD3Q9Y3V2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD3Q9Y3V2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD3Q9Y3V2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD3Q9Y3V2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms