Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLR1DQ9Y2S0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1DQ9Y2S0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms