Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R2

PTPN22, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 22, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN22Q9Y2R2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPN22Q9Y2R2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN22Q9Y2R2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms