Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PIKFYVEQ9Y2I7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIKFYVEQ9Y2I7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms