Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM50BQ9Y247 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM50BQ9Y247 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM50BQ9Y247 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM50BQ9Y247 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms