Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN8AQ9UQD0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN8AQ9UQD0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms