Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IGSF9BQ9UPX0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF9BQ9UPX0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGSF9BQ9UPX0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms