Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRIM35Q9UPQ4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRIM35Q9UPQ4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms