Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCNH3Q9ULD8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNH3Q9ULD8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH3Q9ULD8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms