Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRTO4Q9UKD2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms