Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK28

TMEM59L, Transmembrane protein 59-like, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM59LQ9UK28 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM59LQ9UK28 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM59LQ9UK28 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM59LQ9UK28 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM59LQ9UK28 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM59LQ9UK28 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM59LQ9UK28 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM59LQ9UK28 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM59LQ9UK28 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM59LQ9UK28 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM59LQ9UK28 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM59LQ9UK28 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM59LQ9UK28 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM59LQ9UK28 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM59LQ9UK28 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM59LQ9UK28 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM59LQ9UK28 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM59LQ9UK28 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM59LQ9UK28 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM59LQ9UK28 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM59LQ9UK28 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms