Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN3Q9UHW5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN3Q9UHW5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms